大多數良性病變不會變成惡性病變，但少數良性病變會發生惡變。

良性病變發展過程緩慢，不會發生遠處轉移或破壞周圍組織、器官，且很少會發生惡性病變。但有少部分的良性病變在沒有及時進行處理時會進一步發展，如乙肝肝硬化、絨毛狀結腸腺瘤、腺瘤性腸道息肉等。部分女性低級宮頸上皮內瘤變在持續感染高危型HPV病毒的情況下會進展為高級宮頸上皮內瘤變，又稱為癌前病變。

患者發現組織有良性病變時要定時復查，沒有任何臨床癥狀不用特殊處理；如果患者發現良性病變增大、感染等情況，可進行手術切除，減少惡變機會。