寶寶發燒39度且處于熟睡狀態時，可通過飲食、冷敷、藥物等方式進行醫治。

一、飲食：當寶寶發燒39度處于熟睡中，需叫醒孩子，少量多次給其喂溫開水。這樣能促進排泄，讓熱量被帶走，從而降低體溫。孩子清醒后體溫調節能力會增強，對降溫有幫助作用。

二、冷敷：寶寶發燒39度并在熟睡中，可采用冷敷來治療。可在寶寶的手腕、額頭、小腿處放上濕冷毛巾以降溫，等毛巾溫度升高后再更換，如此重復能起到很好的輔助效果。

三、藥物：若寶寶發燒39度經上述方式治療效果不佳，還可在醫生指導下使用利巴韋林、阿昔洛韋、更昔洛韋等抗病毒藥物進行治療，同時也可遵醫囑使用布洛芬緩釋膠囊、對乙酰氨基酚等解熱鎮痛藥物。

總之，對于寶寶發燒39度且熟睡的情況，要根據具體情況選擇合適的方法來處理，以幫助寶寶盡快降溫恢復健康。