灸法在我國已有二千多年的歷史，其治療效果已為無數臨床實踐所證實。而對其機制的認識，仍是一個未解的迷。現階段認為灸療作用機制與以下5個方面有關。
局部刺激
灸療是一種在人體基本特定部位通過艾火刺激以達到防病治病目的的治療方法，其機制首先與局部火的溫熱刺激有關。正是這種溫熱刺激，使局部皮膚充血，毛細血管擴張，增強局部的血液循環與淋巴循環，緩解和消除平滑肌痙攣，使局部的皮膚組織代謝能力加強，促進炎癥、粘連、滲出物、血腫等病理產物消散吸收;還可引起大腦皮質抑制性物質的擴散，降低神經系統的興奮性，發揮鎮靜、鎮痛作用;同時溫熱作用還能促進藥物的吸收。
經絡調節
經絡學說是祖國醫學重要內容，也是灸療的理論基礎。人是一個整體，五臟六腑、四肢百骸是互相協調的，這種相互協調關系，主要是靠經絡的調節作用實現的。現代研究表明經絡腧穴具有三大特點。
1.經絡腧穴對藥物具有外敏性即用同樣艾灸方法選擇一定的腧穴與一般的體表點，其作用是明顯不同的。
2.經絡腧穴對藥物作用的放大性經絡并不是一個簡單的體表循行路線，而是多層次、多功能、多形態的調控系統。在穴位上施灸時，影響其多層次的生理功能，在這種循環感應過程中，它們之間產生相互激發、相互協同、作用疊加的結果，導致了生理上的放大效應。
3.經絡腧穴對藥物的儲存性腧穴具有儲存藥物的作用，藥物的理化作用較長時間停留在腧穴或釋放到全身，產生整體調節作用，使疾病得以治愈。
調節免疫
許多實驗都證實灸療具有增強免疫功能的作用。灸療的許多治療作用也是通過調節人體免疫功能實現的，這種作用具有雙向調節的特性，即低者可以使之升高，高者可以使之降低，并且在病理狀態下，這種調節作用更明顯。
藥理作用
灸療的用藥情況，雖比不得內治法豐富，但從各種隔物灸及太乙、雷火針灸在臨床應用的情況看也可窺灸療辨證論治之一斑。特別值得一提的是，灸療主要原料艾的功能。清代吳儀洛在《本草從新》中說：“艾葉苦辛，生溫熟熱，純陽之性，能回垂絕之亡陽，通十二經，走三陰，理氣血，逐寒濕，暖子宮，止諸血，溫中開郁，調經安胎，……以之艾火，能透諸經而除百病。”可以毫不夸張地說，離開了艾，灸療學就不存在了。
綜合作用
灸療作用于人體主要表現的是一種綜合作用，是各種因素相互影響、相互補充、共同發揮的整體治療作用。
首先，灸療的治療方式是綜合的
如冬病夏治，以白芥子等藥物貼敷膻中、肺俞、膏肓治療哮喘的化膿灸，以及以隔附子餅灸腎俞等穴的抗衰老等，其方式即包括了局部刺激(局部化膿灸、隔物灸)、經絡腧穴(特定選穴)、藥物諸因素，他們相互之間是有機聯系的，并不是單一弧立的，缺其一即失去了原來的治療作用。
其二，治療的作用是綜合的
灸療熱的刺激對局部氣血的調整，艾火刺激配合藥物，必然增加了藥物的功效，芳香藥物在溫熱環境中特別易于吸收，艾灸施于穴位，則首先刺激了穴位本身激發了經氣，調動了經脈的功能使之更好地發揮行氣血、和陰陽的整體作用。
