補骨脂的副作用
補骨脂具有一定的毒性，有研究實驗顯示，補骨脂酚對小鼠腎臟有選擇性素毒性，而且大劑量補骨脂素類加紫外光照射能引起小鼠輕微的肝臟，生殖器，腎上腺皮質的脂肪樣變、睪丸萎縮，體重減輕。
此外，補骨脂果實中還有一種查耳酮(補骨脂乙素)，可擴張實驗動物的冠狀血管，并能對抗腦垂體后葉素對冠脈的收縮作用，對心肌氧消耗量增加不明顯，但能提高呼吸商，對心肌氧化磷酸化、心肌內糖原和乳酸的影響不大，因此不促進心肌內無氧代謝，所以緩慢給藥毒性很低。
加重便秘
補骨脂主要是補氣補腎的藥，偏熱一些，如果胃腸的熱的人，會引起便秘加重。
如果有便秘且較重的話，不宜在夏天服用這么溫熱的藥物。
引起光感型藥疹
補骨脂為豆科草本植物，功效是補腎壯陽，固精縮尿，溫脾止瀉，但少數人應用該藥經日光照射后，經過一定的潛伏期，于照曬部位出現紅斑、丘疹和水皰，非照曬部位也可以發生。
這種反應可持續甚久，在停用藥后，患者即使無日光的作用也常保持過敏狀態。
因此，已知用補骨脂后出現光變應性皮炎的患者，當再次用該藥后，無皮疹出現也應適當用藥治療，注意防曬一段時間。
用補骨脂后出現藥疹的患者，當皮疹和自覺癥狀消失后，尚需鞏固治療和避免日光照曬1月左右，方可停止治療。
用藥禁忌
陰虛火旺者忌服。
