泡腳養生的科學依據來自以下四大原理
(1)全息原理
生物全息理論指出：在人體的雙足都客觀存在著與人體各臟腑器官相對應的區域，即反射區。通過刺激這些反射區就能調節人體各臟腑器官的生理功能，從而達到治療疾病和自我保健的目的。
雙足有62個基本反射區，像人體的一個縮影，它時時刻刻關注著人體各部的健康情況。經常性地通過中草藥足浴來刺激反射區，能提高藥物的吸收，加快藥物的輸布，在反射區刺激感應和藥物的雙重作用下，促使全身血液的通暢、調節各組織器官的功能，改善臟腑器官的病理變化，提高肌體的免疫力。
(2)經絡原理
早在幾千年前的《黃帝內經》記載：陰脈集于足下，而聚于足心。所謂經脈之行，三經皆起于足。既足部是三條陰經的起點，三條陽經的終點，足部六條經脈的井、滎、俞、原等穴位均位于足部。
在這些經脈上雙足部共有66個穴位，這些穴位對各種刺激都非常敏感，穴位又與全身各臟腑器官密切相連，通過中草藥足浴可起到促進氣血運行，溫煦臟腑的作用，從而達到內病外治，上病下治的效果。
(3)循環原理
大家都知道，我們的下肢體由于離心臟遠，血液循環不是很好，而內臟器的血液循環多是細小的血管，因此血液的回流就更不好。采用中草藥足浴時，一方面由于溫熱效應、藥物作用可以加快血液循環使下肢及內臟中的血液也加入到體循環中來，使人體中毒素及廢物通過新陳代謝的作用排出體外。
另一方面足部的毛細血管及末梢神經都非常豐富，通過刺激這些穴位擴張足部血管，加快血液循環，增強神經敏感程度促使藥物離子的進入，使藥性能快速地通過經絡傳導有效的輸布全身，再結合足部反射區的刺激效應，共同調節臟腑功能，從而起到治療和保健的作用。
(4)物理原理
在中草藥足浴過程中，通過熱能作用、水壓作用、藥物離子運動等物理因子共同作用，刺激足部，以激發機體自身調節作用，促進機體產生抵抗功能，增強機體的免疫功能，從而抑制或減少生物活性物質的釋放，達到調節臟腑代謝和防病治病的功效。
同時在生物負離子能量作用下，使腦垂體的神經細胞、腦腺和淋巴細胞至大限度地被激活，進而提高抗體物質對病菌、病毒的鑒別和殺滅功能，促進體內毒素隨汗腺、泌尿系統等排泄器官排除體外。
