引起雙腎結石的原因有很多，首先可能與飲用的水質不佳有關，飲用水中含有晶體和高物質比較多，人體喝下去之后，會使人體內的尿鈣增加，不能及時的排出體外，就引起結石的形成。
引起雙腎結石有很大一部分的原因就是不良的飲食造成，日常的飲水量太少，導致尿液濃縮，形成結石。吃了很多的蛋白質食物，使腎臟和尿中的鈣、草酸、尿酸的成分普遍增高，從而引起腎結石的產生。
食用過多的草酸食物，比如菠菜、土豆、茶葉、西紅柿、竹筍、大豆、可可等食物，也會引起腎結石的產生，還有一些嘌呤高的食物，比如動物的內臟、海產品、花生、豆角等食物，也會產生尿酸，沉淀而形成尿結石。
使用過多的脂肪、糖分，也會為結石創造條件，因此生活中應該注意飲食的合理，養成良好的飲食習慣，不能挑食，食物要吃的精細，不能經常性的是一種食物，食物要多樣化。
一些不良的生活習慣也會引起腎結石的產生，比如運動量太少，經常的熬夜，生活作息不規律等。一些氣候，比如炎熱的時候，會導致出汗的增多，尿液也會濃縮，從而引起結石的產生。
還有一些疾病，比如甲狀旁腺功能亢進、癱瘓、溶血性骨腫瘤、痛風、骨折等疾病，也會引起腎結石的發生，因為這些疾病能夠使體內尿鈣的增高，從而形成腎結石。
