番木瓜的蛋白性物質無論試管試驗或整體試驗均有顯著的抗凝作用，在抗凝劑量時(狗，2毫克/千克)，對心血管及呼吸系統無明顯作用，大劑量對心臟有直接抑制作用。
由于過敏及引起回腸痙攣，其治療應用仍受限制。
5、降壓作用
番木瓜堿可引起家兔血壓下降，對離體蛙心、兔心引起擴張期停止，使蛙后肢血管收縮，兔耳殼、腎臟、小腸及冠狀血管舒張。
6、抑制平滑肌作用
番木瓜堿抑制腸管(貓、兔及鼠)及氣管(豚鼠)平滑肌，對妊娠子宮(兔及豚鼠)
番木瓜及正常子宮(豚鼠)，少量使之興奮，大量使之麻痹，對骨胳肌則使之麻痹。種子含番番木瓜甙及芥子酶(Myrosin)，前者和芥干甙類似，水解后產生刺激性揮發物。
7、墮胎作用
果實的漿汁對豚鼠子宮有明顯的加強收縮作用，據云種子有墮胎作用，曾用作通經劑及抗刺激劑。
8、心臟和中樞抑制作用
番木瓜堿5毫克給實驗動物靜脈注射，可引起血壓短暫下降，對心臟有抑制作用，減慢心率，5毫克/千克對兔產生毒性反應;此外，有中樞抑制作用。
9、潤膚去皺，美容增顏
因為番木瓜性溫，不寒不燥，其中的營養容易被皮膚直接吸收，特別是可發揮潤肺的功能。
當肺部得到適當的滋潤后，就能更好地行氣活血，使身體更易吸收充足的營養，從而讓皮膚變得光潔、柔嫩、細膩，皺紋減少、面色紅潤。
10、祛除邪毒
番木瓜中含有番番木瓜堿和番木瓜蛋白酶，它們具有抗結核桿菌及寄生蟲如絳蟲、蛔蟲、鞭蟲、阿米巴原蟲等作用，故可用治肺結核、蛔蟲癥、阿米巴肝膿腫等。
