病因
大部分肛瘺由直腸肛管周圍膿腫引起，因此內口多在齒狀線上肛竇處，膿腫自行破潰或切開引流處形成外口，位于肛周皮膚上。由于外口生長較快，膿腫常假性愈合，導致膿腫反復發作破潰或切開，形成多個瘺管和外口，使單純性肛瘺成為復雜性肛瘺。瘺管由反應性的致密纖維組織包繞，近管腔處為炎性肉芽組織，后期腔內可上皮化。
結核、潰瘍性結腸炎、Crohn病等特異性炎癥、惡性腫瘤、肛管外傷感染也可引起肛瘺，但較為少見。
分型分期
肛瘺的分類方法很多，簡單介紹下面兩種。
1、按瘺管位置高低分類
(1)低位肛瘺瘺管位于外括約肌深部以下。可分為低位單純性肛瘺(只有1個瘺管)和低位復雜性肛瘺(有多個瘺口和瘺管)。
(2)高位肛瘺瘺管位于外括約肌深部以上。可分為高位單純性肛瘺(只有1個瘺管)和高位復雜性肛瘺(有多個瘺口和瘺管)。此種分類方法，臨床較為常用。
2、按瘺管與括約肌的關系分類
(1)肛管括約肌間型約占肛瘺的70%，多因肛管周圍膿腫引起。瘺管位于內外括約肌之間，內口在齒狀線附近，外口大多在肛緣附近，為低位肛瘺。
(2)經肛管括約肌型約占25%，多因坐骨肛管間隙膿腫引起，可為低位或高位肛瘺。瘺管穿過外括約肌、坐骨直腸間隙，開口于肛周皮膚上。
(3)肛管括約肌上型為高位肛瘺，較為少見，約占4%，瘺管在括約肌間向上延伸，越過恥骨直腸肌，向下經坐骨直腸間隙穿透肛周皮膚。
(4)肛管括約肌外型少見，僅占1%。多為骨盆直腸間隙膿腫合并坐骨肛管間隙膿腫的后果。瘺管自會陰部皮膚向上經坐骨直腸間隙和肛提肌，然后穿入盆腔或直腸。這類肛瘺常因外傷、腸道惡性腫瘤、Crohn病引起，治療較為困難。
