常呈現間斷性腹部隱痛、腹脹、腹痛、腹瀉為本病主要表現。遇冷、進油膩之物或遇情緒波動、或勞累后尤著。大便次數增加，日行幾次或數十余次，肛門下墜，大便不爽。
慢性腸炎急性發作時，可見高熱、腹部絞痛、惡心嘔吐、大便急迫如水或粘凍血便。
5.腹瀉
該病出現的主要的癥狀就是腹瀉了，一般還是反復發作或者持續得不到治愈。情況較輕時一般每天會出現兩到五次，一般大便都是帶有黏液和膿血。
二、慢性腸炎的并發癥
1.腸穿孔
腸穿孔多為中毒性腸擴張的并發癥，也可出現嚴重型，多發生于左半結腸，皮質激素的應用被認為是腸穿孔的一個危險因素。
2.中毒性腸擴張
中毒性腸擴張臨床表現為病情迅速惡化，中毒癥狀明顯，伴有腹瀉、腹部壓痛和反跳痛，腸鳴音減弱或消失，白細胞數增多，易并發腸穿孔。
3.腸狹窄
腸狹窄多發生在病變廣泛、病程持續長達5-25年以上的病例，其部位多見于左半結腸，乙狀結腸或直腸，臨床上一般無癥狀，嚴重時可引起腸阻塞，在本病出現腸狹窄時，要警惕腫瘤，鑒別良性惡性。
4.結腸癌
慢性腸炎大約有5%病例發生癌變，多見于病變累及全結腸，幼年起病和病史超過10年者。
