結合病史、臨床表現及X線胸片檢查，可以肯定診斷。但應與慢性鼻竇炎、增殖體肥大、睡眠呼吸暫停綜合征、肺結核、變異性哮喘、支氣管擴張癥、纖毛功能異常癥以及胃食管反流等慢性呼吸道疾病相鑒別。
1.支氣管哮喘
起病年齡較輕，以反復咳喘為特征，呈突發突停，發作時兩肺滿布哮鳴音，緩解后無癥狀，常有家族或個人過敏史。以咳嗽為主要癥狀的支氣管哮喘病例，可無喘息或哮鳴音，更須與本病鑒別。
2.肺結核
有發熱、乏力、盜汗及消瘦等癥狀，痰液找到結核桿菌及胸部X線檢查可助鑒別。
3.支氣管擴張
多發生于兒童或青年期，表現為反復發作咳嗽、咳痰、咯血，合并感染時有大量膿性痰。X線胸片常見肺紋理粗亂或呈卷發狀。螺旋CT檢查及支氣管碘油造影有助診斷。
4.慢性鼻竇炎
亦稱慢性化膿性鼻竇炎。常因急性化膿性鼻竇炎反復發作未能得到適當治療所致。以多粘液或膿性鼻涕、鼻塞、頭痛及嗅覺減退或消失為主要臨床癥狀。
5.增殖體肥大
是兒童常見病。多發生于學齡前兒童，有張口呼吸、睡眠打鼾、睡不實、易驚醒，白天精神不振，記憶力差，甚至貧血，精神遲鈍，頭痛等。 可伴有聽力下降或鼻堵及流涕。病程長的可有“腺樣體面容”。
6.兒童阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征(OSAS) 是指每小時睡眠中，阻塞性睡眠呼吸暫停次數≥1次，伴有SaO2<92%
患兒生長發育遲緩，智能障礙及心理行為異常，嚴重者有心肺功能不全。多導睡眠圖檢查可以明確是否患有OSAS。
7. 變異性哮喘
主要表現為刺檄性干咳，通常咳嗽比較劇烈，夜間咳嗽為其重要特征。感冒、冷空氣、灰塵、油煙等容易誘發或加重咳嗽。