兒童再障治療起來較為困難，尤其是兒童重型再障會出現貧血進行性加重，嚴重的感染及顱內出血，嚴重時可危及生命。慢性再障雖癥狀較輕，但治療療程較為漫長。所以預防兒童再障顯得十分重要，那么如何預防兒童再障呢?
首先，應該在生活中盡量避免與已知的能導致再障的化學物質和農藥接觸。
其次，嚴禁濫用藥物。盡量避免使用可能影響造血系統的氯霉素、磺胺等，減少患病的幾率。
最后，要避免接觸放射性物質，從事接觸放射性物質行業的工作人員，需加強防護的意識，嚴格按照操作規程保護自身健康，預防疾病的發生。
此外，對繼發性患者來說，關鍵是剔除導致再障的病因。病毒感染與再障發病有密切關系，最常見的是肝炎病毒。再障多繼發于非甲非乙型肝炎，而與甲型肝炎無聯系。臨床發現有些再障患者發病前有感冒病史，說明部分再障可繼發于普通感冒之后。
加強體育鍛煉，注意飲食衛生，調清志，保持心情舒暢，勞逸結合，增強機體抵抗力，防止感染繼發再障。