由于流感桿菌有引起繼發病例的可能，且化腦又是一嚴重感染，故有人主張對患兒家庭或托幼機構中6歲以下的密切接觸者進行預防投藥。利福平20mg/(kg·d)，分2次口服，每次劑量不超過60mg，連用4天，可有預防效果。
國外已有6型菌苗問世，用于2～60個月的幼兒，認為安全可靠。抗Hib脂多糖包膜-磷酸多核糖體(PRP)抗體是一種保護性抗體。PRP的免疫性較差，與蛋白結合的PRP疫苗免疫性較強，可使2個月以上小兒產生保護性抗體，目前已有4種與蛋白結合的PRP疫苗。1987年美國開始對18個月以上兒童接種結合菌苗。1990年開始對2個月以上嬰兒接種。我國初種年齡為7～11個月，用0.5ml菌苗臀部肌內注射，間隔2個月后加強注射1次。接種 Hib結合菌苗的副作用很少，25%接種者有一過性局部輕微疼痛，注射部位紅腫，在24h內消失。