甲狀腺乳頭狀腺癌患者臨床上一般無自覺癥狀，且癌瘤生長較為緩慢，所以一般就診都會比較晚，從發病開始到就診有些患者可達10—30年之久。而且臨床上多缺乏明顯的惡性表現，約半數以上都被誤診為良性。
除此之外，在診治甲狀腺乳頭狀癌的過程中，若對一些乳頭狀癌的亞型認識程度不夠，則會誤將其列入到其它類型當中。所以必須充分認識甲狀腺乳頭狀癌的亞型癥狀，才能適當準確地做出診斷，使預后良好的乳頭狀癌不會被誤認為是一些預后不良的類型，具有明顯的臨床意義。
1、彌漫濾泡型乳頭狀癌
年輕人多見，呈侵襲性生長，整個甲狀腺葉全部受累而不呈結節狀，易誤認為甲狀腺腫，組織學上以濾泡結構為主，間質纖維化不明顯，但核具乳頭狀癌特征，易轉移至淋巴結(87.5%)、肺(75%)和骨(25%)，對放射性碘治療敏感。
2、彌漫硬化型乳頭狀癌
兒童及年輕人為多，一側或雙側甲狀腺腫大，臨床及病理表現上都類似慢性甲狀腺炎;組織學表現為甲狀腺彌漫性病變，廣泛硬化，明顯淋巴細胞浸潤，砂粒體易見，散在小灶性乳頭狀癌病變，常伴鱗化，淋巴道轉移普遍易見。
3、嗜酸細胞型乳頭狀癌
由嗜酸細胞組成的乳頭狀癌，細胞核具乳頭狀癌特征。
4、小梁狀乳頭狀癌
腫瘤體積較大，侵襲性生長，50%的癌組織呈小梁狀，預后不良。
5、去分化型乳頭狀癌
乳頭狀癌中見到去分化或低分化癌成分，復發癌中見到去分化或低分化成分，預后不良。
6、包膜型乳頭狀癌
有人曾提出過乳頭狀腺瘤的名稱，但由于此腫瘤可發生淋巴結轉移，故仍屬乳頭狀癌的范疇。癌組織由完整包膜包繞，核具乳頭狀癌特征。幾乎不出現遠處轉移和腫瘤致死，故預后良好。
7、微小型乳頭狀癌
多在尸體解剖中偶然見到，直徑1cm 以下，部分有包膜包繞，部分病例無包膜，中央有壞死。約三分之一有淋巴結轉移，但無遠處轉移，預后良好。
8、高柱狀細胞乳頭狀癌
發病年齡稍大，腫瘤體積常較大，組織學上呈高長乳頭，30%以上的癌細胞的高大于寬的2倍，胞漿多嗜酸，核呈乳頭狀癌特征，易擴展至甲狀腺外，遠處轉移和復發。