(一)病史和體檢：病史中多有典型的腎絞痛和血尿，或曾從尿道排出過結石。查體可發現患側腎區有叩擊痛，并發感染、積水時叩擊痛更為明顯，腎積水較重者可觸及腫大的腎臟，輸尿管末端結石有時可經直腸或陰道 指檢觸及。
(二)化驗檢查：尿液常規檢查可見紅細胞、白細胞或結晶，尿pH在草酸鹽及尿酸鹽結石患者常為酸性;磷酸鹽結石常為鹼性。合并感染時尿中出現較多的膿細胞，尿細菌學培養常為陽性，計數大于10萬/ml以上，并發急性感染及感染較重時，血常規檢查可見白細胞總數及嗜中性粒細胞升高。多發性和復發性結石的病人，應測定血、尿的鈣磷值、尿酸值等，以進一步明確結石的病因。
(三)X線檢查：X線檢查是診斷腎及輸尿管結石的重要方法，約95%以上的尿路結石可在X線平片上顯影。輔以排泄性或逆行性腎盂輸尿管造影 ，可確定結石的部位、有無梗阻及梗阻程度、對側腎功能是否良好、區別來自尿路以外的鈣化陰影、排除上尿路的其病變、確定治療方案以及治療后結石部位、大小及數目的對比等都有重要價值。密度低或透光懷石，加以輸尿管、腎盂充氣造影，結石則顯示更為清晰。
(四)其它檢查：B超在結石部位可探及密集光點或光團，合并腎積水時可探到液平段。同位素腎圖檢查可見患側尿路呈梗阻型形。