系統性紅斑狼瘡(SLE)是一種累及多系統，多器官的自身免疫性疾病，若腎臟受累即為狼瘡性腎炎。近年來，國內對于雷公藤用于狼瘡性腎炎治療的研究較多。總的認為，對于處于活動期，但病情較輕的病人，一般單用雷公藤即可取得較好的療效;但如果病情較重，出現大量蛋白尿和血尿等臨床癥狀時，單用雷公藤效果不好，且起效慢，不能迅速控制病情發展，必須用激素或環磷酰胺等免疫抑制劑來治療。有報道認為，對于局灶型和系膜型腎炎療效較好，而對彌漫型則效果差。雷公藤與激素合用，療效可提高1倍，且能減少激素的用量。一般在用藥后4周即能觀察到臨床療效。
雷公藤多甙使用的劑量為每日60毫克，分3次服用，而雷公藤的療效沒有雷公藤多甙好。一般有效的指標為蛋白尿、血尿減少，抗雙鏈DNA抗體、血沉、補體等水平均有不同程度的改善，但抗核抗體沒有變化。