卵巢囊腫切除術是一種針對卵巢囊腫患者直接而有效的治療手段。卵巢囊腫切除術的適合人群有：
非生理性囊腫者
非生理性卵巢囊腫藥物治療通常難以控制，囊腫隨著時間的推移會逐漸增大，壓迫周圍組織，導致患者身體出現不適感，影響正常的生活，因此應及早手術切除。
絕經期或無生育要求者
卵巢囊腫可發生于絕經期或無生育要求患者的一側或雙側卵巢，囊腫過大可考慮全子宮切除。避免卵巢囊腫發生惡變，此類患者應及早手術。
囊腫較大者
若囊腫較大，直徑達到8厘米或以上時，會給患者的身體造成嚴重負擔，出現呼吸困難、尿頻、排尿困難、大便不暢等壓迫癥狀。此類患者應及早手術切除囊腫。
出現嚴重癥狀者
患者出現嚴重癥狀的，如出現急性腹痛，惡心嘔吐，體溫升高等須盡早手術，以免發生危險。
合并腹水者
腹水存在常為惡性腫瘤的特征，但良性囊腫如卵巢纖維瘤及乳頭狀囊腺瘤亦可產生腹水的卵巢囊腫的癥狀。合并腹水的卵巢腫瘤患者應及早手術，以免發生惡變。
惡變傾向者
檢查發現卵巢囊腫有惡變傾向的患者應該及早手術切除囊腫，防止惡變的發生。