自閉癥學生與家庭背景和父母教養的態度無關，亦不是因后天環境造成。 自閉癥可能是由生理因素形成，如神經機能發展、生化機能發展、遺傳因素或腦部受損所致。自閉癥可能是由生理因素形成，如神經機能發展、生化機能發展、遺傳因素或腦部受損所致。
(一)新陳代謝疾病：如苯酮尿癥等先天的新陳代謝障礙，造成腦細胞的功能失調和障礙，會影響腦神經訊息傳遞的功能，而造成自閉癥。
(二)腦傷：包括在懷孕期間窘迫性流產等因素而造成大腦發育不全，生產過程中早產、難產、新生兒腦傷，以及嬰兒其因感染腦炎、腦膜炎等疾病造成腦部傷害等因素，都可能增加自閉癥機會。
(三)遺傳的因素：20%的自閉癥者中，他的家族可找到有智能不足、語言發展遲滯和類似自閉癥的。此外，自閉癥男童中約10%有染色體脆弱癥。
(四)懷孕期間的病毒感染：婦女懷孕期間可能因麻疹或流行性感冒病毒感染，使胎兒的腦部發育受損傷而導致自閉癥。
(五)當然還有其他關于原因方面的探討，但無一確切原因。
關于自閉癥的原因，上文就是詳細介紹，早期發現，早期療育，可以補足自閉癥患者先天學習能力缺陷，減少其不適應、破壞性行為的出現，并使其潛能得以充分發揮，自閉癥如果能及早發現，及早矯治，對其病癥的改善愈有幫助。