三叉神經痛得診斷一般來說是較容易的。診斷主要來自于患者的臨床表現，一般不需要進行特殊的輔助檢查，當懷疑為繼發性三叉神經痛時，應有針對性地進行檢查。
三叉神經痛的主要診斷要點如下
1、發痛部位主要為以下三叉神經分支部位，為眼睛上下，顴骨上下，及嘴部上下位置。
2、多為突然發作的陣發性劇痛，不發作時絕大部分患者完全不痛，僅極少數患者仍有輕度疼痛。
3、大多數患者有“扳機點”即觸發點，刺激這些點可引起疼痛發作，但發作剛過去，再刺激“扳機點”則不引起發作。
4、95%以上的三叉神經患者為一側性，疼痛發作時不合并惡心、嘔吐。
5、早期吃“卡馬西平”等抗神經痛藥物治療有效，對一般如“去痛片”等鎮痛藥物無效。
6、病程冗長，呈逐漸進展趨勢發展。
三叉神經于其他疾病的鑒別
(一) 三叉神經支炎
屬繼發性三叉神經痛，此病發生在眼眶之上，是持續性的疼痛，發作后數日，部分患者會出現帶狀皰疹病毒。此病可自行好轉，對于應用鎮痛藥物、維生素或局部麻醉藥、激素皆有效。
(二) 牙痛
細看牙有無病變，牙痛陣發性不明顯，于食物冷熱關系很大。
(三) 舌咽神經痛
疼痛為陣法性，大多數在吞咽時發作，其次點頭、說話、大笑均可引起發作，疼痛部位一般是耳根和嘴角連線，以下的方向。
(四) 血管性偏頭痛
血管性偏頭痛是周期性、輕重不等的單側頭痛，自身多感覺為腦部深處脹痛，三叉神經痛多感覺為臉部表淺的疼痛。