1、中樞疾病因素
由于，下丘腦-垂體-卵巢軸功能紊亂，引起月經失調，如無排卵性月經，閉經等。垂體腫瘤引起卵巢功能失調而致不孕，精神因素如過度緊張、焦慮對丘腦下部-垂體-卵巢軸可產生影響，抑制排卵。
2、卵巢早衰
卵巢功能障礙導致不排卵的常見疾病為卵巢早衰。出生時卵巢大約有100萬~200萬個始基卵泡，而在青春期大約有40萬個卵泡。每個排卵周期均會消耗一批卵泡。卵巢早衰是指卵巢內的卵泡已消耗完，不可能再用促排卵藥物使卵泡發育。
3、多囊卵巢綜合征
多囊卵巢綜合征也是一種常見的排卵障礙。其病因比較復雜，除了不排卵導致閉經或月經不調外，還可能出現多毛、肥胖、痤瘡等體征。其卵巢的特點為多個小卵泡但卻不能發育成熟，因此需要通過科學治療來促卵泡發育。
4、垂體問題
導致排卵障礙的常見疾病有高泌乳素血癥、垂體泌乳素瘤和希罕氏綜合征等。如果激素測定顯示泌乳素增高，首先要弄清有無垂體泌乳素瘤，如果因垂體瘤引起閉經泌乳，則應根據瘤體大小決定是否手術或藥物治療。