髓內腫瘤因其部位特殊，周圍被“脆弱”的、損傷后不易恢復的脊髓包圍，治療方法選擇上存在著一些分歧。一些學者主張起源于髓內膠質的腫瘤應以放射治療為主，如有的作者認為手術以活檢確立診斷的程度為宜，放療為最好的治療方法。
但是另一些學者診斷脊髓內腫瘤界限清楚的應盡量予根治性手術切除。有作者報告11例髓內腫瘤完全切除9例，其中5例星形細胞瘤3例完整切除，術后神經功能穩定或恢復良好。李有忠等報告17例脊髓髓內腫瘤，9例全部切除，其中室管膜瘤7例，星形細胞瘤1例，血管瘤1例。解放軍總醫院的一組資料認為腫瘤Ⅰ期切除是比較積極的治療方法。
鑒于室管膜瘤以膨脹性生長為主，腫瘤與鄰近脊髓組織分界較清，為髓內腫瘤中最有希望根治性切除的一種。室管膜瘤MRI常表現為實質和囊性兩部分組成。前者為腫瘤存活部分，也是手術切除的重要部分。由于周圍脊髓水腫部分在T2加權象也呈高信號，故T2異常信號要比實際的腫瘤;而且室管膜瘤為富血管性腫瘤，因此手術時應特別注意。
星形細胞瘤多以浸潤性生長為主，腫瘤與鄰近組織多分界不清，除個別具有假包膜者外大多都難以完全切除。李有忠等報告17例脊髓髓內腫瘤中4例星形細胞瘤僅1例完整切除。
脊髓脂肪瘤來源不清。腫瘤多位于軟脊膜下，部分外生性生長，在髓內浸潤性生長與脊髓缺乏明確界限，難以完全切除，應分塊切除減壓。雖不能根治全切，術后神經癥狀也可緩解。
血管性腫瘤髓骨少見，占髓內腫瘤的1%～3%。多位于胸段和頸段。絕大多數發生在脊髓背側，并可同時合并小腦部的血管性腫瘤。故對此種病變在行頸段MRI或CT檢查時，應把小腦納入掃描野，以便同時檢出小腦部的血管瘤。脊髓內血管畸形無并發癥時可不表現癥狀。