脊髓腫瘤需與其他脊髓疾患鑒別，如粘連性蛛網膜炎、多發硬化、肌萎縮性側索硬化、脊髓空洞癥。需鑒別的骨科疾病為脊柱結核、脊柱的退變病。
1.脊柱結構病多有低燒、盜汗等慢性中毒癥狀，病變多侵蝕椎間盤與相應椎體緣，椎旁寒形膿瘍有助于鑒別診斷。
2.退變性脊椎病因椎間盤、韌帶突入椎管引起脊髓和神經受壓。中年以后脊柱退行變的影像學征象幾乎都存在，與脊髓腫瘤的鑒別診斷要靠細致的神經系統評價，輔助以影像學檢查。
能對脊髓或脊神經根產生壓迫的腫瘤，可起源于脊髓實質，神經根，脊膜或脊椎。
原發的脊髓腫瘤比顱內腫瘤少見。大約2/3原發的脊髓腫瘤是脊膜瘤與神經纖維瘤;其余的通常為膠質瘤與肉瘤。大約10%是髓內腫瘤。硬脊膜外轉移性病變通常起源于肺癌，乳腺癌，前列腺癌，腎癌，甲狀腺癌或淋巴瘤(例如，霍奇金病，淋巴肉瘤，網狀細胞肉瘤)。