影響室管膜瘤預后的因素包括腫瘤的部位、組織學類型、復發的速度和年齡等，其中前二者起決定作用。國內資料術后復發平均在20個月內。室管膜母細胞瘤的5年生存率僅為15%。另外一個潛在的重要預后因素是手術切除程度，近全切除組存活率有顯著的提高，50%～60%的腫瘤全切除患者5年內未見腫瘤復發，而次全切除者僅21%。45Gy以上的術后放射劑量可有效控制腫瘤生長。幕上腫瘤與幕下腫瘤的5年生存率分別為35%與59%。幕下室管膜瘤患者年齡大者預后稍佳，10歲以下患者平均生存期為2年，而15歲以上患者平均生存期達4.3～6.0年。復發后腫瘤可出現惡性變，兒童惡性室管膜瘤復發較快，平均復發期限是18個月，預后較差。根據神經影像、腦神經受損體征等所表現出的腦干受侵犯狀況也與預后差密切相關。間變性室管膜瘤預后較差，復發率高，約68%，并易沿腦脊液播散。5年生存率較室管膜瘤低，為25%-40%。室管膜下室管膜瘤術后患者一般預后良好，極少見復發或腦脊液播散。