醫源性尿路感染屬于醫院內交叉感染的范疇。醫院內的交叉感染是一重要的醫院管理問題，也是流行病學經常探討的問題。在醫院環境中，空氣是交叉感染的很重要的途徑，除此之外，通過工作人員的手及各種診斷治療用的器械及設備與病人直接接觸，也是不可忽視的感染途徑。
一般來說，醫院內的感染最重要的部位是呼吸道，死亡率也高，其次就是泌尿系統的感染。有關數據表明，尿路感染可占醫院內感染的35%～50%。而在這些尿路感染的病例中，75%～80% 是由導尿管所引起，其余則為經尿道操作及開放性手術所致。如上所述凡行1次導尿術就有1 %～2%的感染機會，若留置導尿管3～4天行開放性引流，則50%～70%的患者將有感染，凡留置導尿管10天以上感染率將為100%。由此可知，插置導尿管是引起醫院內尿路感染的主要原因，導尿管的處理在醫院內尿路感染的發生、預防方面有著重要的意義。
帶有導尿管的患者，細菌入侵的途徑有三
1行導尿術時，操作步驟無菌要求不嚴而污染導尿管，或將尿道前端的細菌種植于膀胱;2在導尿管與尿道粘膜之間的空隙有一層薄的尿道分泌物，細菌可在粘液中繁殖，然后上行而感染膀胱;3細菌可沿導尿管的內腔上行而感染膀胱，尤其是開放性的留置導尿管。了解這些導尿管之所以能引起感染的原因，無疑有助于預防。
醫院內尿路感染的病原菌仍以大腸桿菌為最重要，約占50%以上，而且是抗藥性很強的菌株，其余病原菌則為變形桿菌、綠膿桿菌及克雷伯氏桿菌等，這些也是抗藥性強毒力大的細菌，一旦引起菌血癥或敗血癥，則可導致中毒性休克，死亡率高。
導尿及其它一切經尿道操作固然可以損傷尿道粘膜，破壞其自然防御感染的屏障，但患者的全身情況，諸如老年、長期消耗性疾病、糖尿病、器官移植患者或惡性腫瘤接受有抑制免疫功能的藥物者，亦為尿路感染發病的重要而不應忽視的因素。當前，經尿道手術較為廣泛應用，而患者常為高齡，80歲以上患者并非鮮見，且往往伴有心血管、腦血管疾患，對這些患者尤應重視尿路感染的預防。