中醫認為霍亂的病因不外感受時邪和飲食不慎兩個方面，《丹溪心法》，“內有所積，外有所感，致成吐瀉。”感受時邪包括，夏秋之際，暑濕蒸騰，調攝失職則易感受濕穢濁疫癘之氣，或因貪涼露宿，寒濕內侵，客邪穢氣，郁遏中焦，均能使脾胃受傷，運化失常，氣機不利，升降失司，清濁相干，亂于腸胃，上吐下瀉。或由飲食不慎，誤進腐餿變質之物，或貪涼受冷，恣食生冷瓜果，暴飲暴食，最能損傷脾胃，導致運化失常，清濁混淆而成霍亂。
但是由于患者體質的不同，會有不同的表現，若患者中陽不足，脾不健運，或重感寒濕，或貪涼飲冷，則病從寒化而成濕霍亂;或患者素體陽盛，或平素濕熱內蘊，復感時令熱邪，以及喜食辛辣醇厚之物，病從熱化而成熱霍亂。
辨寒濕與濕熱，若中陽素虧，脾運不健，或重感寒濕，或畏熱貪涼，過食生冷瓜果，則病從寒化而成為寒霍亂。表現為暴起嘔吐清水或如米泔，瀉下清稀便或如米泔，腹冷痛或不痛，小便稍黃或清，口不渴，或肢倦畏寒，苔白膩，脈緩細。若患者素體陽盛，或濕熱內蘊，或長途烈日冒暑遠行，復感時令熱邪，以及過食辛辣醇酒厚味等食物，濕熱自內而生，則病從熱化而成為熱霍亂。表現為吐瀉驟作，嘔吐酸腐熱臭，瀉下黃水或有泡沫，腹痛如絞勢急，小便黃赤，口渴，發熱煩躁，苔黃膩，脈數。