門靜脈高壓病因各異，其發病原因迄今為止也仍未完全闡明，但門靜脈血流受阻是其發病的根本原因，但并非惟一原因，過去本癥的病因學分類眾多，諸如 Whipple，Leevy，Sherlock，Dolle，Friedel等，現根據本癥近年來發病機制的研究進展，結合其病因和解剖部位，又考慮到簡單實用，引用Bass & Sombry分類法進行介紹。
1、原發性血流量增加型
(1)動脈-門靜脈瘺(包括肝內，脾內及其他內臟)。
(2)脾毛細血管瘤。
(3)門靜脈海綿狀血管瘤。
(4)非肝病性脾大(如真性紅細胞增多癥，白血病，淋巴瘤等)。
2、原發性血流阻力增加型
(1)肝前型：發病率<5%。
?、傺ㄐ纬桑洪T靜脈血栓形成;脾靜脈血栓形成;門靜脈海綿樣變。
②門靜脈或脾靜脈受外來腫瘤或假性胰腺囊腫壓迫或浸潤，或門靜脈癌栓。
(2)肝內型：發病率占90%。
?、俑]前型：早期血吸蟲病，先天性肝纖維化，特發性門靜脈高壓，早期原發性膽汁性肝硬化，膽管炎，肝豆狀核變性，砷中毒，硫唑嘌呤肝毒性，骨髓纖維化(早期)，結節病，骨髓增生性疾病等。
②竇型/混合型：肝炎肝硬化，酒精性肝硬化，脂肪肝，不完全間隔性纖維化，肝細胞結節再生性增生，維生素A中毒，氨甲喋呤中毒，晚期血吸蟲病及膽管炎等。
③竇后型：肝靜脈血栓形成或栓塞，布-卡氏綜合征等。
(3)肝后型：占1%，下腔靜脈閉塞性疾病，縮窄性心包炎，慢性右心衰，三尖瓣功能不全(先天性，風濕性)等。