包皮過長和包莖、海綿體硬結癥、隱匿陰莖等，要時刻注重其變化。包皮過長，包皮口狹小和包莖，會導致包皮垢和尿在包皮腔內積留，誘發陰莖頭包皮炎，產生膿性分泌物及表皮脫落，嚴重者可引起包皮和陰莖頭潰瘍或結石形成，造成尿道外口狹窄，發生急性尿潴留。嚴重的陰莖外口狹窄會束縛陰莖的發育，影響生育。
陰莖頭包皮炎的反復發作，還可使患者變得情緒不寧和神經質。
中年患者易患陰莖硬結癥，輕易發展成隱伏的陰莖纖維性海綿體炎斑塊，失去正常的彈性而出現陰莖彎曲。一旦勃起不僅疼痛且會彎曲變形，影響正常性生活，甚至引起陽萎。當勃起時陰莖彎曲變形持續1年以上或斑塊鈣化者，應當及早手術。
陰莖陰囊轉位，常并發尿道下裂。尿道下裂是常見的尿道和外生殖器畸形，嚴重的需進行染色體檢查和性腺檢查，通過手術重建尿道，以獲得完整的外生殖器。
陰莖扭轉，即陰莖頭偏離中線，嚴重的患者有礙性交，有時會導致患者無法正常自立排尿。還會影響患者健康性心理的形成，影響正常的社交活動。
先天性睪丸缺失，或外傷后睪丸丟失，睪丸扭轉、睪丸腫瘤、前列腺腫瘤、睪丸萎縮、尿道疾患、陰莖變形等，都會引起相應的癥狀，對患者的心理產生嚴重影響，或造成生育困難，或有生命危險，應及時醫治，最終達到：正常的排尿、理想的性生活、滿足的外觀、健康的性心理。