黃體功能不足所致不孕癥的治療應根據不同的病因采取不同的治療方案。常用方法有：
(1)黃體酮增補療法：這個方法用得最廣泛，不論何種病因，凡查到黃體中期孕酮值低，內膜活體組織檢查分泌相欠佳或經臨床觀察確認為黃體功能不足者多可使用。具體方法為：
①黃體酮陰道栓25mg塞入陰道深部或直腸內，早晚各一次，由病人自用，于基礎體溫上升后2 天開始(月經周期第16天或17天)到月經來潮時止。
②黃體酮油劑，每日肌肉注射10mg，或隔日肌肉注射20mg，基礎體溫上升后第2天起使用。
③合成孕激素：安宮黃體酮2mg，每日3次，或每晚服5mg，基礎體溫上升后2天起開始用藥。羥孕酮：每周肌肉注射2次，每次125mg，基礎體溫升高后第2天開始用藥。
黃體酮增補療法治療不孕癥的用藥時間一般多主張在排卵后2～3天開始給藥，即使是對習慣性早期流產，也應和治不孕癥患者一樣自排卵后2～3天即開始用藥。至于停藥時間，有些學者認為應在排卵后第14天停藥，以防假孕。也有人主張用藥至月經來潮時始停藥。如果延期不見來潮可做早孕試驗，當證實為妊娠時應繼續給藥至12孕周。至于用合成孕激素治療，不論是注射法或口服法，都不能代替黃體酮。
(2)絨毛膜促性腺激素(HCG)：用于排卵前可以誘發排卵，用于排卵以后則可刺激黃體發育，支持黃體功能，增加孕酮合成，延長黃體壽命。用法是于排卵后 3～4天起，隔日肌肉注射HC G2000～3000u，共3～4次;或排卵后3天起，每日肌肉注射1000u，連續7～8日。
(3)克羅米芬：應用克羅米芬誘發排卵曾發現有部分患者黃體功能欠佳。但有報道認為對自然排卵患者，尤其在用孕酮增補療法無效時可于卵泡早期，即從月經周期第3天起每日服克羅米芬50mg，連服5日，可提高妊娠率。
(4)溴隱亭：黃體功能不良的不孕患者，伴有血清催乳素升高者可用溴隱亭治療:每日1～2 次，每次2 5mg。