肝癌是危及人生命的常見病，早期診斷、及早治療是延長壽命的重要手段。但由于肝臟隱匿在上腹深部，外有肋骨為其屏障，故腫大早期不易發現;另外，肝臟有強大的代償能力，早期常無癥狀，這也給肝癌的早期診斷帶來一定的困難。因此，對于肝癌的早期診斷，在無癥狀的人群中發現早期病例，可有效的降低肝癌的病死率。
肝癌在診斷時需注意以下疾病的鑒別：
1、繼發性肝癌：繼發性肝癌與原發性肝癌比較，繼發性肝癌病情發展緩慢，癥狀較輕，其中以繼發于胃癌的最多，其次為肺、結腸、胰腺、乳腺等的癌灶常轉移至肝。常表現為多個結節型病灶，甲胎蛋白(AFP)檢測除少數原發癌在消化的病例可陽性外，一般多為陰性。
2、肝硬化：肝癌多發生在肝硬化的基礎上，兩者鑒別常有困難。鑒別在于詳細病史、體格檢查聯系實驗室檢查。肝硬化病情發展較慢有反復，肝功能損害較顯著，血清甲胎蛋白(AFP)陽性多提示癌變。
3、活動性肝病：以下幾點有助于肝癌與活動性肝病(急慢性肝炎)的鑒別。AFP甲胎球蛋白檢查和SGPT谷丙轉氨酶必須同時檢測。
4、肝膿腫：表現發熱、肝區疼痛、有炎癥感染癥狀表現，白細胞數常升高，肝區叩擊痛和觸痛明顯，左上腹肌緊張，周圍胸腔壁常有水腫。
5、肝海綿狀血管瘤：該病為肝內良性占位性病變，常因查體B型超聲或核素掃描等偶然發現。該病我國多見。鑒別診斷主要依靠甲胎蛋白測定，B型超聲及肝血管造影。
6、肝包蟲病：患者有肝臟進行性腫大，質地堅硬和結節感、晚期肝臟大部分被破壞，臨床表現極似原發性肝癌。