目前，治療肛周尖銳濕疣多采用局部療法與全身療法相結合的方法。不同的治療方法，有各自的適應癥及其優缺點，選擇正確的治療方法對治療疾病有重要作用。那么究竟治療肛周尖銳濕疣的方法有哪些?我們應該怎樣進行治療呢?
1.藥物治療。包括免疫制劑(如聚肌胞)，抗病毒制劑(如無環鳥苷口服)，中藥制劑等多種藥物，只能輔助治療。
2.冷凍療法。液氮或二氧化碳干冰冷凍，使濕疣組織壞死。其最大好處是去除疣組織快，但在治療過程中出現局部紅腫，疼痛及水泡潰瘍反應，目前少采用。
3.激光療法。常用的是二氧化碳激光，燒灼疣體，一般1次就可脫落。由于激光過于集中，適用于疣體不太大的濕疣。激光療法見效快，但復發率也高。
4.電燒治療。電燒灼是一種較老的治療方法，用高頻電刀燒灼疣體及贅生物。其特點是操作簡單，減小快。但是，損傷面積大，燒灼創面恢復慢，復發率較高。
5.手術治療。對帶蒂較大、孤立的或疑有惡變質的疣體及贅生物可以采用。有的患者尖銳疣體生長過于迅速，或大于菜花，也可考慮手術治療。為防止復發，手術應該配合其他治療。
6.光動力療法。此方法療效確切，清除率高，復發率低，安全無創，不需麻醉，無痛苦。最大的優勢是可以清除潛伏感染病灶及HPV亞臨床感染，顯著減低復發率。尤其適用于尿道，宮頸內及肛周周圍等特殊部位的治療。同時，特別適用于易復發的濕疣及其他方法無效的尖銳濕疣。光動力療法，是目前最理想的療法。