西醫(yī)療法
腸結核的治療目的是消除癥狀、改善全身情況、促使病灶愈合及防治并發(fā)癥。強調早期治療，因為腸結核早期病變是可逆的。
休息與營養(yǎng)
休息與營養(yǎng)可加強患者的抵抗力，是治療的基礎。
抗結核藥物
抗結核藥物是本病治療的關鍵。藥物的選擇、用法、療程同肺結核。應嚴格遵守“早期、規(guī)則、聯合、適量、全程”的治療原則。強化期：異煙肼(H)300毫克每日一次、利福平(R)600毫克每日一次、吡嗪。
中醫(yī)療法
1.辨證治療
(1)濕熱內蘊
治法：清化濕熱。
方藥：葛根芩連湯加味。方中黃芩、黃連苦寒清熱燥濕;葛根解肌清熱、升清止瀉。可加銀花助其清熱之力，茯苓、木通、車前子增強利濕之效，使?jié)駸岱窒瑒t泄瀉自止。若濕偏重，證見胸腹?jié)M悶，口不渴，或渴不欲飲，可加蒼術、佩蘭、厚樸燥濕寬中。
(2)肝氣乘脾
治法：抑肝扶脾。
方藥：痛瀉要方為主方。方中白術健脾補虛，白芍養(yǎng)血柔肝，陳皮理氣醒脾，防風升清止瀉。
(3)脾胃虛弱
治法：健脾益氣。
方藥：參苓白術散為主方。本方用四君子湯以補氣健脾為主，加入和胃理氣滲濕之品，標本兼顧。若脾陽虛衰，陰寒內盛，腹中冷痛，手足不溫，宜用附子理中丸加吳萸、肉桂以溫中散寒。若久瀉不止，中氣下陷，而致脫肛者，可用補中益氣湯，益氣升清，健脾止瀉。
2.簡易方治療
銀花90g，當歸60g，地榆30g，麥冬30g，生甘草10g，苡米15g，黃芩10g。水煎服，每日2次。
中藥
(1)加味香連丸6g。每日2次。用于濕熱泄瀉。
(2)參苓白術丸6g，每日2次，用于脾虛泄瀉。
(3)補中益氣丸6g，每日2次，用于中氣下陷者。
針灸
1.針灸以補益脾胃與溫補腎陽為主。取脾俞、章門、中脘、天樞、足三里、命門、關元等穴。針用補法，可灸。
2.拔火罐選天樞、關元、足三里、上巨虛、下巨虛、大腸俞、小腸俞等穴。適用于慢性虛寒性泄瀉。
3.耳針取大腸、小腸、肺、脾、下腳端等穴。可針刺，也可貼敷。