右下腹或臍周隱痛及鈍痛，多在進食后誘發，伴不全性腸梗阻者，腹痛呈持續性，陣發性加劇。
大便習慣改變，腹瀉，糞便呈糊狀，可含粘液，不伴里急后重，便血少見。或腹瀉與便秘交替出現。
增殖型腸結核，多以便秘為主。多伴有發熱、盜汗、消瘦、全身乏力、惡心、嘔吐、腹脹、食欲減退等癥狀。
另外應注意詢問有無結核病史及既往檢查治療情況，是否行抗癆治療，療程及療效如何。
體驗發現
右下腹有固定性壓痛點，并發腸梗阻時可有腸鳴音亢進、腸型及蠕動波，增殖型腸結核右下腹可觸及包塊，一般比較固定，中等質硬，伴有輕重不等的壓痛。
另外有貧血征象、詳細檢查患者存在哪些體征有助于判斷病情輕重及腸結核的病理分型。
典型病例的診斷一般無困難。但疾病早期，常因癥狀不明顯或缺乏特征性而易漏診。下列幾點可做為診斷本病的依據。
一、臨床表現有長期發熱、盜汗、腹痛、腹瀉(或便秘)的青壯年患者。
二、肺結核或其它腸外結核患者原病灶已好轉，但消化道癥狀和結核毒血癥狀反見加重者。
三、右下腹腫塊伴壓痛，或出現原因不明的不完全性腸梗阻表現者。
四、胃腸X線檢查回盲部有激惹、鋇劑充盈缺損或狹窄征象者。
對于疑有腸結核的患者，在初步排除相關的疾病后，仍難確診時，可給予抗結核藥物，治療兩周，觀察療效，以幫助診斷。