1.激素治療
有一部分隱睪的患者是由于內分泌原因造成的。如我們前面所述，胎兒在母體時其睪丸下降與母體促性腺激素密切相關。據此，近年來許多學者采用先使用LH-RH(促性腺激素釋放激素)而后用HCG(絨毛膜促性腺激素) 獲得比較好的治療效果。HCG療法治療總量以1萬～2萬單位為宜，具體方法為1500單位隔日一次。
2.等待療法
正常情況下，嬰兒出生時睪丸已下降入陰囊，但也有一部分嬰兒，由于胚胎發育延遲的緣故，睪丸的下降時間可以推遲到出生后3個月到1年。因此，如初生時嬰兒有隱睪，可不必急于采用藥物或手術方法試圖將隱睪復位，可耐心等待，期待隱睪自動下降。曾有人觀察了3612名男嬰，發現真正隱睪極少在1歲之后再下降，這提醒我們，不采取積極措施，單純等待的療法只適用于2歲以內。
另有一種短期大劑量沖擊療法，每天肌注4000～6000單位共3天。如治療有效，用藥后2～3周，睪丸即有可能降入陰囊。其適宜的治療年齡在2～9歲，在這前后均無效。合成LH-RH鼻內噴霧法，方法為LH-RH(1毫克/毫升)1.2毫克，每天分6次鼻內噴霧，一個療程為4周。本法對幼兒較適用，使用本法無效者中再用HCG仍可有效，故上述二法可聯合應用。
3.手術治療
①睪丸固定，開刀將睪丸強行固定在陰囊內，乃治療隱睪癥最主要和最有效方法，大多數患者采用此法可獲得成功治療。手術時機選擇十分重要，過早可能失去隱睪自行下降的機會，過晚又將影響睪丸的功能，過去主張2～5歲為宜，最遲不超過6歲。近年有學者提出宜在2歲前就手術治療，理由是2歲后患兒的睪丸組織已經發生病理變化。
②睪丸移植，隨著顯微外科手術的廣泛開展，用自體睪丸移植法治療高位隱睪獲得較好效果。醫生別出心裁地將整個隱睪連同它的血管一齊切下，“搬家”到陰囊里，再在顯微鏡下手術，將睪丸血管小心地吻合在腹壁下動、靜脈上，以保證睪丸的血液循環。
③睪丸切除術，一旦發現睪丸明顯發育不良，萎縮變小或質地變軟等喪失功能情況，應毫不留情地將隱睪切除，以防日后發生惡變。