潰瘍性結腸炎是一種病因尚不十分明確的慢性非特異性炎癥性疾病,但考慮與以下因素有關。免疫功能一般認為本病與免疫異常有關,腸道細菌、病毒感染、食物、精神創傷、遺傳、外傷、寄生蟲等可能為誘發因素。因臨床上應用腎上腺皮質激素及免疫抑制劑對部分潰瘍性結腸炎患者有關。

　　1、精神因素

　　精神因素在潰瘍性結腸炎發病中的作用可能與精神障礙引起自主神經功能失調，導致腸壁炎癥及潰瘍形成有關。但有作者將潰瘍性結腸炎患者與正常人群進行對照研究發現在疾病發作時并沒有明顯的精神誘因。相反，因潰瘍性結腸炎而行結腸切除術后，病人原有的精神上的病態如抑郁癥、焦慮、緊張多疑等癥狀有顯著改善。似乎說明精神因素不是引起本病的原因，更像是本病引起的后果。

　　2、遺傳因素

　　一些資料表明，潰瘍性結腸炎與遺傳因素密切相關。種族差異表現在白種人的發病率明顯高于黑種人，亞洲人的發病率最低。其中白種人的猶太人發病率比非猶太人高2～4倍，而在有色人種大約少50%。單卵雙生雙胞胎發病率比雙卵雙生者高。同時有作者報告在潰瘍性結腸炎患者的組織相關抗原HLA-DR2較正常人增多。

　　3、感染學說

　　已經證明某些細菌和病毒在潰瘍性結腸炎的發病過程中起重要作用。因本病的病理變化和臨床表現與細菌痢疾非常相似，某些病例糞便中培養出細菌，部分病例應用抗生素治療有效，似乎提示細菌性感染與本病有關。因此提出某些細菌或病毒可能在潰瘍性結腸炎的發病過程中起重要作用。但究竟哪種病原體感染引起本病，感染性病原體是本病的原因還是結果還需要進一步的研究才能確定。

　　4、免疫學因素

　　持此觀點的人認為自身免疫介導的組織損傷是潰瘍性結腸炎發病的重要因素之一。有作者發現某些侵犯腸壁的病原體(如大腸桿菌等)與人體大腸上皮細胞存在著交叉抗原，當機體感染這些病原體以后，循環中的自身抗體不僅與腸壁內的病原體作用也同時殺傷了自身的上皮細胞。

　　近年來從潰瘍性結腸炎患者結腸上皮內發現了一種40KD的抗原，可在激活機體產生抗結腸上皮抗體的同時也激活結腸上皮表面的補體及抗原抗體復合物。潰瘍性結腸炎患者的免疫淋巴細胞和巨噬細胞被激活后，可釋放出多種細胞因子和血管活性物質，促進并加重組織的炎癥反應。有報告CD95(TNF類)所介導的結腸上皮細胞凋亡在潰瘍性結腸炎的發病機制中的作用。發現在潰瘍性結腸炎患者結腸炎癥區域及其相鄰的非炎癥區域均發生了CD95-CD95L所介導的細胞凋亡，推論其可能是潰瘍性結腸炎蔓延的可能原因之一。