前列腺囊腫的常見病因有
(1)真性前列腺囊腫
前列腺腺體在胚胎發育期內受到障礙，進而引起前列腺導管狹窄，造成阻塞，內容物逐漸潴留而形成，故屬于潴留性前列腺囊腫。
(2)先天性囊腫
為中腎導管與中腎旁管發育異常，管腔部分擴張而形成囊腫。起于中腎旁管的囊腫常位于前列腺后正中處，而起自中腎導管的囊腫則居于兩旁。這種囊腫并非起自前列腺，常與膀胱后壁粘連。其體積往往可長到很大，壓迫膀胱頸引起排尿困難;壓迫直腸引起肛門墜脹感與排便困難。先天性前列腺囊腫常伴有尿道下裂、隱睪、腎發育不全等先天性疾病。
(3)后天性囊腫
系由堅韌的前列腺基質導致腺泡不完全梗阻，逐漸使腺泡上皮變厚，終至發生潴留性囊腫，可位于前列腺內的任何部位或突出至膀胱頸部，直徑為1~2 cm。
(4)炎癥性囊腫
系前列腺慢性炎癥引起結締組織增生，導致前列腺導管狹窄，分泌物潴留形成囊腫。
(5)寄生蟲性囊腫
由于寄生蟲引起，如包蟲能使前列腺管及周圍發生慢性炎癥，或由肉芽增生，逐漸形成囊腫。上述各種囊腫以潴留性前列腺囊腫最常見，可發生于腺體任何部分。