1、潛伏期
尚未有準確報道。目前估計在7天以內，一般為1-3天。
2、臨床癥狀
臨床癥狀急性起病，早期表現類似普通型流感，主要為發熱，體溫大多持續在39℃以上，熱程1～7天，一般為3～4天，可伴有流涕，鼻塞，咳嗽，咽痛，頭痛和全身不適，部分患者可有惡心，腹痛，腹瀉，稀水樣便等消化道癥狀，多數輕癥病例預后良好。重癥患者病情發展迅速，可出現肺炎，急性呼吸窘迫綜合征，肺出血，胸腔積液，全血細胞減少，腎功能衰竭，敗血癥，休克及Reye綜合征等多種并發癥，嚴重者可致死亡。治療中若體溫持續超過39℃，需警惕重癥傾向。感染者癥狀較輕，大多數患者可出現眼結膜炎，少數患者伴有溫和的流感樣癥狀。H9N2感染者僅引起一過性的流感癥狀，尚無死亡病例報道。
3、體征
重癥患者可有肺部實變體征等。
4、并發癥
多數輕癥病例預后良好，且不留后遺癥。某些病例病情發展迅速，出現重癥肺炎、急性呼吸窘迫綜合征、肺出血、胸腔積液、全血細胞減少、多臟器功能衰竭、敗血癥、休克及Reye綜合征等多種并發癥，可導致死亡。