(1)細菌性腹瀉是指各種細菌引起的腹瀉。能引起腹瀉的細菌有致瀉性大腸桿菌、沙門氏菌、霍亂弧菌、志賀氏菌、彎曲桿菌等。
(2)由病毒感染引起的腹瀉叫病毒性腹瀉。能引起腹瀉的病毒主要有輪狀病毒、杯狀病毒、腺病毒等。
(3)真菌性腹瀉是指由真菌感染腸道引起的腹瀉。能引起腹瀉的主要病原菌為白色念珠菌、放線菌、新型隱球菌和毛霉菌。
(4)會引起腹瀉的寄生蟲有腸賈第鞭毛蟲、小隱孢子蟲、溶組織阿米巴和環(huán)孢子蟲等，他們是兒童急性腹瀉常見的病因。
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