小兒慢性常導致營養不良，進而引起死亡。全世界每年約有500萬兒童死于這種情況，成為兒童死亡的第一位原因。在我國北京地區小兒慢性腹瀉主要由沙門氏菌引起，并同時伴有腸道功能失調。急性菌痢轉為慢性菌痢者約占10%-15%，小兒慢性菌痢比成人少得多，急轉慢者在1%以下。
小兒患慢性腹瀉時的診療方法是
(1)首先要進行細菌培養及大便常規檢查，弄清腹瀉原因，有針對性地進行抗菌治療。
(2)調整。腹瀉患兒，大部分有雙糖酶水閏的下降。此時，如果禁食，可以減輕腹瀉但饑餓更加重營養不良;如不控制飲食，必加重腹瀉。此時需要有一個飲食調整階段，給患兒以“特殊飲食”，我們稱之為“飲食療法”。對大部分病兒，效果十分明顯。飲食的配制，主要采用脫脂奶、米湯及糕干粉。
(3)加強全身及腸道局部抵抗力，提高機體免疫功能。慢性腹瀉患兒的腸粘膜與大便中免疫球蛋白a含量明顯下降，是腹瀉慢性化的原因。常采用胸腺肽等免疫調節劑，必要時輸新鮮血，并注意補充鈣、鉀及各種微量元素。