每種疾病都有一定的潛伏期，但是非淋病尿道炎潛伏期較難確定，尤其是性伴侶較多或無癥狀病原體攜帶者。
典型的癥狀是尿道刺癢、輕重不一的尿頻、尿急、尿痛和排尿困難。專家希望患者可以在日常中了解病癥的治療特點，這樣有助于康復。
1、患者是否按時、按量治療
因為非淋菌性尿道炎的治療不同于淋病能做到短期足量治療，而且服藥次數多，持續時間長。
2、性伴侶如有感染應同時治療
不但患者本身要治療，其性伴侶也應接受預防性的藥物治療。方法與患者相同，如為孕婦，可用紅霉素或阿莫西林等藥物治療治療。
3、對于已經多所醫院治療而未愈的患者
要詳細了解病情和療程，若按正規療法而無好轉或無效者，應改換另一種方法，甚至聯合治療。聯合治療時一般不要用同類抗生素。
4、已有不少報告分解尿素支原體對四環素有耐藥性
若疑屬于這種情況，則及時用其他抗生素。
5、如果患者反復發作，應警惕并發癥
如前列腺炎等，應做相應的細菌學查，并及時治療。