嬰幼兒腹瀉是多種病因引起的腹瀉綜合征。隨著醫學科學檢測手段的進展，引起腹瀉的病原逐漸被認識，而在過去的年代里曾出現過不同的診斷名稱，如消化不良、急性胃腸炎、嬰兒腹瀉和小兒腸炎等。為了便于防治、教學和科研工作的進行，1982年全國小兒腹瀉協作組會議提出將腹瀉分為感染性腹瀉和非感染性腹瀉兩大類。
除細菌性痢疾、阿米巴痢疾、霍亂和鼠傷寒的原有固定診斷名稱繼續延用外，其他細菌性如大腸桿菌、空腸彎曲菌等，病毒性如輪狀病毒、柯薩奇病毒等，寄生蟲、真菌及一些原因不明的感染性腹瀉，一律稱為小兒腸炎。對病原明確者要加以說明，如輪狀病毒引起的小兒腸炎稱為輪狀病毒腸炎，致病性大腸桿菌引起的腸炎稱致病性大腸桿菌腸炎。
腹瀉病因分類
1 腸道內感染
(1)病毒性
輪狀病毒、柯薩奇病毒、埃可病毒、巨細胞病毒、腺病毒、諾沃克病毒等。
(2)細菌性
產毒素性細菌
產毒素性大腸桿菌、霍亂弧菌、難辨梭狀芽胞桿菌等。
侵襲性細菌
痢疾桿菌、侵襲性大腸桿菌、空腸彎曲菌、鼠傷寒沙門氏菌、耶耳森腸炎桿菌、金黃色葡萄球菌等。
(3)寄生蟲性
腸梨形鞭毛蟲、溶組織阿米巴、蟯蟲、鉤蟲等。
(4)真菌性
白色念珠菌等。
2 腸道外感染
上呼吸道感染、中耳炎、肺炎、腎盂腎炎、皮膚感染、敗血癥等。
3 非感染性腹瀉
喂養、護理不當，氣候驟變，食物過敏，藥物副作用。