在肥厚型心肌病預后的因素中，合理的生活指導是有利的因素。本病患者應避免劇烈活動，避免使用正性肌力藥及擴張血管藥物，注意入浴時間不宜過長、禁止煙酒、防治感染，以改善預后，預防要求具體如下：
1.肥厚型心肌病一經確診，不管其有無左室流出道梗阻均不能參加劇烈活動。
2.以下為高危患者，除限制參加劇烈活動外，需進行預防性治療：①Holter顯示有持續性或非持續性室速;②在40歲以前其家族中有由于肥厚型心肌病而猝死者;③曾出現意識喪失和暈厥;④左室流出道壓力階差>6.67kPa(50mmHg);⑤運動誘發低血壓;⑥重度二尖瓣反流，左房內徑≥50mm，陣發性心房顫動;⑦有心肌灌注異常證據。其改善預后的預防性治療措施包括β受體阻滯藥、鈣拮抗藥、胺碘酮等的應用。
3.本病患者可并發感染性心內膜炎，因此在拔牙、心導管檢查時可能增加感染機會的情況下，預防性使用抗生素可以防止此類并發癥。
4.病程發展緩慢，預后不定。可以穩定多年不變，但一旦出現癥狀則可以逐步惡化。猝死與心力衰竭為主要的死亡原因。猝死多見于兒童及年輕人，其出現和體力活動有關，與有無癥狀或有否梗阻有關，心室壁肌厚程度高，有猝死家族史，有持續性室性心動過速者為猝死的危險因子，猝死的可能機制包括快速室性心律失常，竇房結病變與心傳導障礙，心肌缺血，舒張功能障礙，低血壓，以前二者最重要。心房顫動的發生可以促進心力衰竭。少數患者有感染性心內膜炎或栓塞等并發癥。