1、疾病
主要包括消耗性疾病，如重度肺結核、嚴重貧血、營養不良等，特有的內分泌疾病，如"肥胖生殖無能性營養不良病"等;體內一些內分泌系亂的影響，如腎上腺、甲關腺、胰腺等功能紊亂。這些原因的影響，都可能不來月經。但是這幾種情況引起的閉經，只要疾病治好了，月經也就自然來潮。
2、生殖道下段閉鎖
如子宮頸、陰道、處女膜、陰唇等處，有一部分先天性閉鎖，或后天損傷造成粘連性閉鎖，雖然有月經，但經血不能外流。這種情況稱為隱性或假性閉經。生殖道下段閉鎖，經過醫生治療，是完全可以治愈的。
3、生殖器官不健全或發育不良
有的人先天性無卵巢，或卵巢以育不良，或卵巢頎壞，不能產生雌激素和孕激素，因此子宮內膜不能發生周期性的變化，也就不會出現子宮內膜脫落，所以也就沒有月經來潮。也有的先天性無子宮，或子宮內膜發育不良，或子宮內膜損傷，即使卵巢功能健全，雌激素和孕激素的分泌正常，也不會來月經。
4、結核性子宮內膜炎
這是由于結核菌侵入子宮內膜，使子宮內膜發炎，并受到不同程度的破壞，最后出現瘢痕組織，而造成閉經。因此，得了結核性子宮內膜炎，應該及時治療，不可延誤。
5、腦垂體或下丘腦功能不正常
腦垂體能分泌促性腺激素。促性腺激素有調節卵巢功能和維持月經的作用。如果腦垂體的功能失調，就會影響促性腺激素的分泌，進面影響卵巢的功能，卵巢功能不正常就會引起閉經。另外，下丘腦功能不正常也會引起閉經。引起下丘腦功能失調的原因很多，如精神刺激、悲傷憂慮、恐懼不安、緊張勞累，以及環境改變、寒冷刺激等。由下丘腦引起的閉經比較多見。