兒童再障是由各種原因導致的骨髓造血功能衰竭，臨床上主要表現為貧血、出血、感染。
干細胞缺乏或機能缺陷是再障的原因。如嚴重再障患者的骨髓造血干細胞培養顯示，定向祖細胞減少，提示多能干細胞減少或機能障礙。
多能干細胞在特定的微環境條件下增殖更新。再生障礙性貧血也可能由于骨髓造血微環境缺陷造成。實驗表明骨髓基質或微環境在血細胞增殖和成熟中的重要性。
再障也可能是細胞或體液免疫對造血細胞抑制的結果。近年來注意力集中于造血細胞的免疫抑制。如用抗淋巴細胞血清治療再障獲得成功，在同卵雙胎移植中常常需要免疫抑制治療，只有50%同卵雙胎再障患者骨髓移植獲得成功，其余50%只有免疫抑制進行預處理才能成功。
再生障礙性貧血發病機理假說，有人將多能干細胞，造血微環境和免疫反應之間的關系，比喻為“種子”、“土壤”和“蟲子”之間的關系，可能還要加“肥料”，這幾種成份中，可能任一成分缺陷都會導致再障的發生。