沙眼衣原體感染是近年來才發現的性病。因此，在生活中提高人們對沙眼衣原體的認識，自覺地進行自我防護，才會降低整個社會的發病率。
(1)杜絕性亂無論是對沙眼衣原體感染，還是對其他性病，都是最主要的預防措施。生活作風嚴謹，不參與淫亂嫖娼，不涉足婚外性行為，才能從根本上防患于未然。
(2)要注意個人衛生：個人的洗浴用品、毛巾獨自使用;不穿借別人的內衣、泳衣;外出期間不洗盆塘;盡量使(轉載自中國健康網http://www.69jk.cn，請保留此標記。)用坐式馬桶，上廁所前洗手。這些做法可以減少接觸感染的機會。
(3)配偶患沙眼衣原體感染期間要禁止性生活。現代醫學有許多藥物可以治療沙眼衣原體感染，而且用藥方便，患者只需堅持治療就會很快恢復健康。治療應在夫妻之間同時進行，婦女患病可能沒有明顯癥狀，不要因為沒有癥狀就拒絕治療而成為隱性傳染者。
(4)孕婦如果感染沙眼衣原體可以用紅霉素治療。治療后復查，確認痊愈后才能從陰道分娩