若經常灌洗會導致陰道內自然健康的分泌物及菌體被清除，破壞陰道內的酸性環境，容易受到感染。同時細菌有被沖進子宮腔的可能，引起上行感染。
有些人認為灌洗陰道可以預防性病，便喜歡每次房事后尤其是當對方不愿使用避孕套時，用清水或清洗劑灌洗陰道。
實際上灌洗陰道并不好，因為陰道內有一些正常細菌生長，其中一種是乳酸桿菌，它可以使陰道內維持偏酸性的環境，對一些細菌的生長有很好的抑制作用。若經常灌洗會導致陰道內自然健康的分泌物及菌體被清除，破壞陰道內的酸性環境，容易受到感染。同時細菌有被沖進子宮腔的可能，引起上行感染，如附件炎、盆腔炎等。而且經常灌洗會造成陰道內干燥和瘙癢，性交時容易造成陰道黏膜的損傷，這就非常容易使HPV等病毒通過陰道粘膜的損傷縫隙進入人體，從而引起尖銳濕疣感染。
綜上所述，灌洗陰道并不能預防尖銳濕疣，反而破壞了生殖環境，得病的概率更大。所以還要科學預防，不可盲目。