一、宮腔積膿
當病情發展，子宮內膜轉化為干酪樣組織或形成潰瘍時，即可形成宮腔積膿，嚴重者可以引起宮腔感染。
二、月經異常
由于結核桿菌侵犯子宮內膜，導致子宮內膜不能正常剝落而引起月經異常。有的患者可發生月經量減少、間隔時間增長、甚至出現閉經;
三、不孕癥
不孕，可以分為絕對性不孕和相對性不孕。通過治療仍不受孕者，稱為絕對性不孕癥;經過治療仍有受孕可能者，稱為相對性不孕癥。
子宮內膜結核當屬相對性不孕癥。子宮內膜結核是導致不孕的主要原因之一。本病原發灶大多是肺結核，其次是腹膜結核，血行播散，先侵入輸卵管，再蔓延至子宮內膜，導致受精卵無法正常著床于子宮內膜。從而導致不孕癥的發生。
由于結核菌對輸卵管的破壞較嚴重，應用足夠的抗結核藥物后獲得正常妊娠的機會也甚微。曾有人綜合700O余例患者的妊娠率發現，化療后獲得正常妊娠者僅31例，占0.44%，輸卵管妊娠125例，流產67例。