藥物治療
急性扁桃體炎有傳染性，應適當隔離。因本病多為鏈球菌感染，應用抗菌素及磺胺類藥物，療效較好。抗生素首選青霉素，青霉素過敏者可選用紅霉素、林可霉素等。高熱頭痛及全身酸痛者可選用阿司匹林等解熱鎮痛劑。經2—3日治療后如病情無好轉，則應考慮是否病毒或其他細菌感染，改用抗病毒藥、敏感抗生素或磺胺類藥物，可酌情使用腎上腺皮質激素，如潑尼松、地塞米松等。此外，應注意休息、通大便、多飲水、冷流食，并給適量退熱止痛藥、漱口藥水等，多數患者可在1周左右恢復。
急性化膿性扁桃體炎
全可用朵貝爾氏液含漱，4小時1次。兩側下頜角部位熱敷或超短波透熱理療有消炎作用。
手術治療
慢性扁桃體炎尚無肯定有效的保守療法，但中藥、扁桃體局部用藥、冷凍、理療等皆有人試用。也可進行扁桃體切除術。過去，為防止扁桃體病灶引起嚴重并發病，扁桃體切除術甚為普遍。近年由于認識到扁桃體具有免疫功能，對切除扁桃體是否有益發生爭議。故手術已較前有所減少。對手術適應癥、手術效果及切除扁桃體是否會影響機體免疫功能等也存在不同見解。據近年研究，扁桃體參與體液免疫和細胞免疫，可以產生合成各種免疫球蛋白的B淋巴細胞。
因此有人認為切除扁桃體可以影響局部免疫功能，但對全身免疫功能無影響。以下情況可以行扁桃體切除術 1、反復急性發作或有扁桃體周圍膿腫史者;
2、可能是引起其他部位病變的原發病灶;
3、影響正常呼吸或吞咽功能。為防止對免疫功能有不良影響，一般在6歲以前不行扁桃休切除術。影響吞咽及呼吸者，可以切除一側扁桃體，以解除功能障礙。有出血傾向，繼發病活動期手術可能造成繼發病惡化以及病人健康條件不允許時，則不應手術。