慢性腹瀉的病因較為復雜，主要可分為胃部疾病、腸道疾病、肝膽胰疾病以及全身疾病這四大類。

一、腸道疾病：這是最為常見的。

1.感染性腹瀉：常見的有因沙門氏菌、金黃色葡萄球菌等導致的腹瀉。

2.非感染性腹瀉：像中青年女性中多見的潰瘍性結腸炎就屬于此類。

3.腸道腫瘤：結腸癌、直腸癌等腸道腫瘤也是引發慢性腹瀉的常見因素。

二、胃部疾病：常見于胃癌、萎縮性胃炎以及胃部手術后的病人，通常是由于胃酸分泌不足或食物過快進入腸道而引起。

三、全身性疾病：例如甲狀腺功能亢進。

四、膽胰腺疾病：如膽囊切除術后、胰腺癌，慢性胰腺炎會因胰腺內分泌的免疫功能不足而誘發腹瀉。

總之，慢性腹瀉的病因多樣，需要仔細分辨和診斷，以便采取針對性的治療措施。