做腦血栓手術可能會存在后遺癥。

首先，可能可導致在穿刺部位（如股動脈）形成血栓或血腫的情況，這可能會對股動脈造成壓迫，進而引起肢體血管的栓塞，導致肢體的疼痛或乏力。其次，如果手術后血栓脫落，可能會引起急性的梗塞，導致一側肢體的癱瘓、麻木等癥狀。再者，腦血栓手術后，如果患者沒有規律地服用抗血小板和穩定斑塊的藥物，容易在支架內再次形成血栓。此外，顱內出血、感染、腦水腫、血管損傷等并發癥也可能在手術后出現。

但請注意，這些后遺癥和并發癥并非一定可導致，其發生概率和嚴重程度受多種因素影響，包括手術的成功率、患者的身體狀況、術后的護理和治療等。