早上醒來眼皮腫疼可能有多種原因，分析如下：

1.睡眠不足

長期熬夜或睡眠質量不佳，身體得不到充分的休息，可能導致眼皮部位過度充血，出現局部腫脹、疼痛等癥狀。

2.情緒波動

自身情緒激動，在哭泣時會產生大量淚液，從而引起眼瞼部位組織周圍出現滲透壓變化，部分水分會滲入到眼瞼組織間隙，導致眼瞼腫脹，同時刺激局部感覺神經，出現眼皮腫疼的癥狀。

3.麥粒腫

大多數為眼瞼腺體金黃色葡萄球菌感染，引起的急性化膿性炎癥。在病原菌的刺激下，可引起患者出現眼皮腫疼，也可伴有眼睛瘙癢、異物感等。建議在醫生指導下進行抗感染治療。