注射宮頸癌疫苗常出現局部紅腫、硬結、瘙癢等副作用，部分患者還會出現發燒嘔吐，休克頭暈等癥狀。注射疫苗后一個周內要戒煙戒酒；要注意避孕；也不要碰到水；還要保證足夠的睡眠時間。

會出現皮疹、頭暈、惡心等特點，但幾天后就會消失。如果有些人對這種疫苗的敏感性特別高，還有少數表現為肌肉痙攣和麻痹。已經接種了疫苗者不用太擔心，若出現類似不適，一定要注意，馬上到醫院就診。疫苗的接種時間比較長，在女性月經的幾年直到閉經階段都可以接種疫苗，即便是50歲左右的女性朋友也可以打預防宮頸癌疫苗，半年內分幾次進行注射。另外，宮頸癌疫苗還有可能會導致人體出現各種高危的因素。